Para ilmuwan menemukan gen yang umum di antara orang-orang dengan infeksi virus korona yang parah

Para ilmuwan menemukan gen yang umum di antara orang-orang dengan infeksi virus korona yang parah


Oleh The Washington Post 34m yang lalu

Bagikan artikel ini:

Oleh Ben Guarino

Varian gen tertentu terkait dengan infeksi virus corona yang parah, menurut tim ilmuwan di Eropa yang mempelajari genom dari 2.200 pasien Covid-19 yang sakit kritis.

Hasil mereka memberikan dukungan kuat bahwa susunan genetik berperan dalam penyakit yang berpotensi fatal yang dialami oleh beberapa orang yang terinfeksi oleh virus corona.

Menyelami DNA manusia adalah pendekatan yang dapat membantu menjawab salah satu misteri terbesar pandemi: Mengapa beberapa orang memiliki kasus virus korona ringan, atau tidak ada gejala sama sekali, sementara yang lain dengan cepat jatuh sakit dan mati?

Bukti jelas bahwa usia yang lebih tua dan kondisi yang mendasarinya adalah faktor risiko peningkatan keparahan Covid-19. Tetapi kecenderungan genetik untuk peradangan yang tak terkendali atau respons imun berbahaya lainnya juga dapat berkontribusi pada penyakit yang lebih buruk.

Mengetahui hal ini, para peneliti bekerja untuk mengungkap gen yang terkait erat dengan sistem biologis untuk mempercepat pengembangan obat untuk Covid-19.

“Tujuan utama kami dalam pekerjaan ini adalah untuk menemukan pengobatan yang efektif,” kata penulis studi Kenneth Baillie, seorang peneliti klinis Universitas Edinburgh dan seorang penyelidik di GenOMICC Consortium, yang mengeksplorasi hubungan antara gen dan penyakit kritis.

Baillie dan rekan-rekannya menunjukkan delapan titik pada kromosom – lima di antaranya bertahan kuat di bawah pengawasan lebih lanjut – di mana varian lebih umum di antara orang-orang dalam perawatan intensif. Beberapa gen mengandung instruksi untuk komponen anti-virus dari sistem kekebalan, menunjukkan kelemahan dalam pertahanan mikroskopis seseorang yang mungkin diperbaiki oleh terapi, setidaknya dalam teori.

“Melihat ribuan orang, ada sedikit variasi dalam seberapa banyak sinyal untuk setiap orang; variasi ini muncul karena perbedaan genetik antara orang-orang,” kata Baillie. “Pada skala ini, kami dapat melihat efek dari variasi ini, sehingga kami dapat secara langsung memprediksi efek obat yang mengenai sistem kekebalan di tempat yang sama.”

Menerjemahkan hasil dari jenis penyelidikan ini menjadi terapi yang berhasil, secara umum, merupakan perjuangan yang berat. Prosesnya seringkali membutuhkan penelitian yang panjang bahkan sebelum obat siap untuk diuji pada manusia.

“Tidak ada jaminan bahwa ketika sebuah gen ditemukan, menargetkan gen itu akan menghasilkan kemanjuran terapeutik,” kata Tom Hemming Karlsen, seorang dokter di Universitas Oslo yang tidak berpartisipasi dalam penelitian baru tersebut. Dia menambahkan: “Apa studi genetika seperti ini kemudian lakukan adalah mereka membantu kami menemukan titik awal yang sangat spesifik” untuk penyelidikan lebih lanjut.

Dalam apa yang dikenal sebagai studi asosiasi genom, Baillie dan rekan-rekannya memeriksa gen lebih dari 2.000 pasien Covid-19 di unit perawatan intensif di seluruh Inggris, dan membandingkan mereka dengan gen orang sehat. Penelitian yang diterbitkan baru-baru ini di jurnal Nature, sejalan dengan laporan sebelumnya yang juga menemukan varian dalam susunan genetik pasien yang sakit kritis.

Laporan baru itu adalah “terbitan terbesar hingga saat ini dari jenisnya,” kata Karlsen. Dia adalah salah satu penulis makalah, yang diterbitkan awal tahun ini di New England Journal of Medicine, yang menggunakan proses ilmiah yang sama untuk mengidentifikasi varian gen yang terkait dengan Covid-19 yang parah.

Studi itu menemukan orang dengan golongan darah A berisiko lebih tinggi terkena infeksi parah, sementara memiliki golongan darah O agak dikaitkan dengan efek perlindungan. Ia juga mencatat lokasi pada kromosom 3 yang terkait dengan kegagalan pernapasan.

Pekerjaan baru mendeteksi hubungan ke kromosom 3 juga, meskipun bagaimana cluster itu berhubungan dengan Covid-19 yang parah masih belum jelas. Terlebih lagi, “beberapa dari temuan baru mampu menunjukkan secara langsung ke gen dengan fungsi yang diketahui terkait dengan sistem kekebalan atau tanggapan antivirus,” kata Karlsen.

Di antara kaitan baru dengan penyakit parah adalah gen bernama IFNAR2. Gen itu memungkinkan sel untuk membangun reseptor protein untuk molekul kekebalan yang kuat, yang disebut interferon karena kemampuannya untuk mengganggu replikasi virus. Ini adalah bagian dari respons pertama tubuh melawan infeksi. Tetapi respons interferon yang lemah dapat memungkinkan virus berkembang biak dengan cepat. Hal itu, pada gilirannya, dapat mengakibatkan koreksi berlebih yang berpotensi mematikan ketika pertahanan kekebalan kemudian masuk.

Studi tersebut mengungkapkan bahwa “varian genetik, terutama gen dekat yang terlibat dalam apa yang disebut respons imun interferon memainkan peran penting dalam menyebabkan infeksi Covid-19 yang mengancam jiwa,” kata Lude Franke, ahli genetika statistik di Universitas Groningen. , yang tidak terlibat dalam laporan Nature.

Para ahli mengingatkan jenis investigasi ini jarang menghasilkan bukti untuk hubungan sebab-akibat langsung antara gen tertentu dan keparahan penyakit atau kerentanan terhadap infeksi.

“Sebagian jawabannya ada di dalam gen kita” tetapi “tidak mungkin satu elemen bertanggung jawab penuh atas perkembangan Covid-19 yang parah,” penulis studi Sara Clohisey, seorang peneliti di Universitas Edinburgh, menunjukkan.

“Ini lebih cenderung menjadi kombinasi faktor,” katanya, yang mungkin termasuk genetika serta usia, obesitas, jenis kelamin, dan karakteristik lainnya. (Meskipun pria lebih mungkin meninggal karena infeksi virus korona daripada wanita, para ilmuwan tidak mendeteksi varian genetik yang terkait dengan seks dalam penelitian ini.)

Namun Baillie mengatakan bahwa pekerjaan ini memberikan “bukti kausal,” khusus untuk gen IFNAR2, dan satu lagi, yang disebut TYK2, bahwa “produk dari gen tersebut mengubah kesempatan seseorang untuk menjadi sakit kritis dengan Covid”.

Karlsen mengatakan bahwa “varian genetik yang sangat jarang, tetapi lebih merusak dalam gen yang sama, dapat memberikan pendorong yang lebih kuat menuju penyakit parah, seperti yang terlihat pada IFNAR2.”

Interferon telah diuji sebagai kemungkinan terapi Covid-19 dalam uji klinis, meskipun satu uji coba besar menemukan pemberian interferon kepada pasien yang dirawat di rumah sakit tidak mengurangi angka kematian. Penulis penelitian juga mencatat bahwa obat anti-inflamasi baricitinib, yang digunakan untuk mengobati rheumatoid arthritis dan diuji pada pasien Covid-19, dapat menghambat protein yang dikodekan oleh gen TYK2.

Para peneliti berencana untuk terus menganalisis sampel DNA dari pasien virus corona – tidak hanya mereka yang sakit parah dan dalam perawatan intensif, tetapi juga dari orang-orang yang memiliki gejala yang lebih ringan.

Tidak ada kekurangan donor potensial saat wabah terus berlanjut. “Pandemi masih berkecamuk,” kata Clohisey. Sejak mereka mulai menulis makalah ini, katanya, para peneliti telah melipatgandakan sampel DNA orang-orang yang terjangkit virus corona sebanyak tiga kali lipat.


Posted By : Result HK